รายละเอียด(อย่างย่อ) ทวีปในตำนานได้จมหายไปในมหาสมุทร! พวก "โคนัน" ต้องตามหา "ดอกเตอร์อากาสะ" และ "ผลไม้แห่งปัญญา" พร้อมตามล่าความจริงเรื่องแอตแลนติส ทวีปที่ถูกเล่าขานว่ามีอารยธรรมเจริญรุ่งเรืองถึงขีดสุดของมนุษยชาติ แต่กลับหายสาบสูญไปในพริบตา! ทำให้พวกเขาต้องใช้ทุกความรู้เพื่อค้นหาทวีปที่หายสาบสูญ แม้ในที่สุดจะสำเร็จ แต่ก็กลับพบอุปสรรคยิ่งใหญ่ที่ทำให้เอาชีวิตแทบไม่รอด มาเอาใจช่วยกันเถอะ! มารู้จักคำว่า "ปรัชญา" จากนักปรัชญาที่โด่งดัง เรียนรู้อารยธรรมจากนครโบราณแต่เก่าก่อน! หรืออารยธรรมกรีกโบราณ ต้นกำเนิดของยุโรป! โอลิมปิกโบราณมีต้นกำเนิดมาจากงานเทศกาลงั้นรึ!? ตามหาแอตแลนติส! ทวีปที่สาบสูญเคยอยู่ที่ไหนกันแน่!