รายละเอียด(อย่างย่อ) โรคติดต่อที่ทำให้โลกตกอยู่ในยุคมืด ปีศาจร้ายค่อย ๆ คืบคลานเข้ามาแล้ว "พวกโคนัน" ที่มาโผล่ในยุคมืดต้องเผชิญหน้ากับภัยอันตราย ที่ร้ายแรงที่สุดในประวัติศาสตร์มนุษยชาติ! ขณะที่ "ไทม์ดริฟเตอร์" กำลังเดินทางตามหา "ดอกเตอร์อากาสะ" ที่แถบชานเมืองทางตอนเหนือของดินแดนเยอรมนี ในช่วงยุคกลาง พวกเธอได้ตัดสินใจพักในหมู่บ้านแห่งหนึ่ง และกำลังตื่นเต้นสุด ๆ เมื่อพบว่าจะมีคณะละครสัตว์เดินทางมาทำการแสดงที่นี่ แต่พวกเธอยังไม่รู้ว่ามีภัยร้ายแสนอันตรายกำลังค่อย ๆ คืบคลานเข้ามาพร้อมกันนั้นด้วย!